Indiska arméns talesperson Raesh Kalia uppger att två soldater dödades i eldgivning på torsdagen, och ytterligare fyra skadades i området Nowgam. En soldat dödades av pakistanska styrkor i området Poonch natten till torsdagen.
Pakistans utrikesdepartement har i sin tur kallat upp Indiens ambassadör i Islamabad. Protesten gäller indiska brott mot vapenvilan vid gränsen.
Enligt den indiska versionen öppnade pakistanska soldater eld för att understödja militanta grupper att ta sig över gränsen till Indien i det omstridda Kashmir.
Pakistan svarar med att man endast moraliskt och diplomatiskt stödjer dem i Kashmir som vill bli fria från indiskt styre.