Nu uppges även fotbolls-EM vara i fara för den franske mittfältaren.
Enligt klubben har 26-åringen slitit av en lårmuskel.
"När han sköt kände han kraftig smärta, han hade inte känt av några varningstecken innan", säger Bayern-tränaren Hans-Dieter Flick till klubbens hemsida.
Efter det ska Tolisso ha fallit ihop och gråtit av smärtan innan han lämnade planen på en bår.
Enligt klubben kan han bli borta i månader och därmed missa EM som inleds 11 juni.